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Date(s) - 04/10/2017
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INRIA/IRISA
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Quand la bio-imagerie rencontre la bio-informatique : vers une intégration des données hétérogènes
Cette journée, organisée par les axes Bio-imagerie et Bio-informatique du réseau Biogenouest, a pour objectif de sensibiliser les deux communautés de chercheurs aux apports respectifs des données -omics et des données extraites de l’imagerie. Les outils informatiques permettant les traitements et la gestion des données seront également présentés dans un objectif global d’intégration de ces données hétérogènes.
| 9:30 – 10:00 | Accueil des participants | ||
| 10:00 – 10:30 | Au-delĂ de la localisation, mieux comprendre l’activitĂ© des molĂ©cules biologiques via l’acquisition d’images haute dimension et leur analyse quantitative – SĂ©bastien Huet, IGDR, Rennes | ||
| 10:30 – 11:00 | Bioinformatique et omics [Titre Ă confirmer] – Sophie Limou, Ecole Centrale de Nantes | ||
| 11:00 – 11:30 | Comprendre et quantifier le dĂ©veloppement prĂ©implantatoire humain embryonnaire par des approches combinĂ©es de bio-informatique et d’imagerie – Laurent David, Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie, Nantes | ||
| 11:30 – 12:00 | Projet fĂ©dĂ©rateur MoDaL – Alban Gaignard, UMR 1087, Nantes | ||
| 12:00 – 13:30 | DĂ©jeuner | ||
| 13:30 – 13:50 | Les micro-fluctuations de la longueur du fuseau mitotique rĂ©vèlent sa dynamique au cours de la division cellulaire – HĂ©lène Bouvrais, IGDR, Rennes | ||
| 13:50 – 14:10 | Gestionnaires d’environnements logiciels – Anthony Bretaudeau, Plate-forme GenOuest, IRISA, Rennes | ||
| 14:10 – 14:30 | Docker et GoDocker: des outils de virtualisation lĂ©gère pour le calcul – Olivier Sallou, Plate-forme GenOuest, IRISA, Rennes | ||
| 14:30 – 14:50 | Gestionnaires de workflow – Eric Charpentier, Plate-forme BiRD, Nantes | ||
| 14:50 – 15:20 | Pause cafĂ© | ||
| 15:20 – 15:40 | IntĂ©gration de Platform-Manager Ă CeSGO – Sylvain Prigent, Axe Bio-imagerie de Biogenouest | ||
| 15:40 – 16:00 | Linked Data: quelques exemples d’intĂ©gration sĂ©mantique de donnĂ©es en bioinformatique – Alban Gaignard, UMR 1087, Nantes | ||
| 16:00 – 16:20 | Cryo-tomographie Ă©lectronique de spĂ©cimens vitrifiĂ©s – Denis ChrĂ©tien, IGDR, Rennes | ||
| 16:20 – 16:40 | Gestion et analyse d’images Ă moyen dĂ©bit : exemple en microscopie confocale et sur lames virtuelles  – Perrine Paul-Gilloteaux, Plate-forme MicroPICell, Nantes | ||
| 16:40 – 17:00 | Shanoir et le projet OFSEP [Titre Ă confirmer] – Plate-forme Neurinfo, Rennes | ||
| 17:00 | Mot de conclusion et clôture de la journée | ||
| 16:50 – 17:00 | ClĂ´ture | ||
L’inscription est gratuite mais obligatoire (déjeuner offert).
Merci de vous inscrire avant le 27 septembre en remplissant le formulaire en ligne.
Centre de recherche Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Campus universitaire de Beaulieu, Rennes
Voir Plan d’accès.