JournĂ©e d’animation bio-informatique et bio-imagerie : 4/10/2017 – INRIA/IRISA

Posted by Olivier Collin on
Loading Map....

Date / Heure
Date(s) - 04/10/2017
Toute la journée

Emplacement
INRIA/IRISA

Catégories


Quand la bio-imagerie rencontre la bio-informatique : vers une intégration des données hétérogÚnes

Cette journĂ©e, organisĂ©e par les axes Bio-imagerie et Bio-informatique du rĂ©seau Biogenouest, a pour objectif de sensibiliser les deux communautĂ©s de chercheurs aux apports respectifs des donnĂ©es -omics et des donnĂ©es extraites de l’imagerie. Les outils informatiques permettant les traitements et la gestion des donnĂ©es seront Ă©galement prĂ©sentĂ©s dans un objectif global d’intĂ©gration de ces donnĂ©es hĂ©tĂ©rogĂšnes.

9:30 – 10:00 Accueil des participants
10:00 – 10:30 Au-delĂ  de la localisation, mieux comprendre l’activitĂ© des molĂ©cules biologiques via l’acquisition d’images haute dimension et leur analyse quantitative – SĂ©bastien Huet, IGDR, Rennes
10:30 – 11:00 Bioinformatique et omics [Titre Ă  confirmer] – Sophie Limou, Ecole Centrale de Nantes
11:00 – 11:30 Comprendre et quantifier le dĂ©veloppement prĂ©implantatoire humain embryonnaire par des approches combinĂ©es de bio-informatique et d’imagerie – Laurent David, Centre de Recherche en Transplantation et Immunologie, Nantes
11:30 – 12:00 Projet fĂ©dĂ©rateur MoDaL – Alban Gaignard, UMR 1087, Nantes
12:00 – 13:30 DĂ©jeuner
13:30 – 13:50 Les micro-fluctuations de la longueur du fuseau mitotique rĂ©vĂšlent sa dynamique au cours de la division cellulaire – HĂ©lĂšne Bouvrais, IGDR, Rennes
13:50 – 14:10 Gestionnaires d’environnements logiciels – Anthony Bretaudeau, Plate-forme GenOuest, IRISA, Rennes
14:10 – 14:30 Docker et GoDocker: des outils de virtualisation lĂ©gĂšre pour le calcul – Olivier Sallou, Plate-forme GenOuest, IRISA, Rennes
14:30 – 14:50 Gestionnaires de workflow – Eric Charpentier, Plate-forme BiRD, Nantes
14:50 – 15:20 Pause cafĂ©
15:20 – 15:40 IntĂ©gration de Platform-Manager Ă  CeSGO – Sylvain Prigent, Axe Bio-imagerie de Biogenouest
15:40 – 16:00 Linked Data: quelques exemples d’intĂ©gration sĂ©mantique de donnĂ©es en bioinformatique – Alban Gaignard, UMR 1087, Nantes
16:00 – 16:20 Cryo-tomographie Ă©lectronique de spĂ©cimens vitrifiĂ©s – Denis ChrĂ©tien, IGDR, Rennes
16:20 – 16:40 Gestion et analyse d’images Ă  moyen dĂ©bit : exemple en microscopie confocale et sur lames virtuelles  – Perrine Paul-Gilloteaux, Plate-forme MicroPICell, Nantes
16:40 – 17:00 Shanoir et le projet OFSEP [Titre Ă  confirmer] – Plate-forme Neurinfo, Rennes
17:00 Mot de conclusion et clÎture de la journée
16:50 – 17:00 ClĂŽture

L’inscription est gratuite mais obligatoire (dĂ©jeuner offert).

Merci de vous inscrire avant le 27 septembre en remplissant le formulaire en ligne.

Centre de recherche Inria Rennes – Bretagne Atlantique, Campus universitaire de Beaulieu, Rennes

Voir Plan d’accùs.