Date / Heure
Date(s) - 10/05/2017
Toute la journée
Emplacement
INRIA/IRISA
Catégories
Présentation
L’analyse des données biologiques nécessite de plus en plus l’utilisation de ressources et d’environnements informatiques difficiles à maîtriser pour le biologiste.
Cette formation présente et décompose l’utilisation de l’environnement Galaxy.
En se basant sur une plateforme web, comme c’est la cas avec Mobyle, cet environnement propose une nouvelle approche pour rendre l’analyse biologique plus aisée pour les non- informaticiens.
Objectifs
Prise en main de l’environnement Galaxy et des différentes fonctionnalités proposées.
Organisation pédagogique
La formation est exclusivement orientée pratique! Il s’agir d’utiliser des données de RNAseq fournies par l’UMR 0598 Agrocampus-Ouest / INRA pour utiliser les outils classiques d’analyse de données RNAseq (Tophat, flagstat, Cufflinks, Cuffcompare, Cuffdiff, ou htseq-count, Deseq…)
Public visé
Chercheurs et ingénieurs, biologistes souhaitant s’initier à l’analyse de données RNAseq.
Pré-requis
Aucun.
Durée
– 1 journĂ©e incluant 3h d’initiation Ă Galaxy
Bookings
Les réservations sont closes pour cet évènement.