Analyse de données RNA-seq sous GALAXY

Posted by Cyril MONJEAUD on
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Date / Heure
Date(s) - 10/05/2017
Toute la journée

Emplacement
INRIA/IRISA

Catégories


Présentation

L’analyse des donnĂ©es biologiques nĂ©cessite de plus en plus l’utilisation de ressources et d’environnements informatiques difficiles Ă  maĂźtriser pour le biologiste.
Cette formation prĂ©sente et dĂ©compose l’utilisation de l’environnement Galaxy.
En se basant sur une plateforme web, comme c’est la cas avec Mobyle, cet environnement propose une nouvelle approche pour rendre l’analyse biologique plus aisĂ©e pour les non- informaticiens.

Objectifs

Prise en main de l’environnement Galaxy et des diffĂ©rentes fonctionnalitĂ©s proposĂ©es.

Organisation pédagogique

La formation est exclusivement orientĂ©e pratique! Il s’agir d’utiliser des donnĂ©es de RNAseq fournies par l’UMR 0598 Agrocampus-Ouest / INRA pour utiliser les outils classiques d’analyse de donnĂ©es RNAseq (Tophat, flagstat, Cufflinks, Cuffcompare, Cuffdiff, ou htseq-count, Deseq
)

Public visé

Chercheurs et ingĂ©nieurs, biologistes souhaitant s’initier Ă  l’analyse de donnĂ©es RNAseq.

Pré-requis

Aucun.

Durée

– 1 journĂ©e incluant 3h d’initiation Ă  Galaxy

Bookings

Les réservations sont closes pour cet évÚnement.