Outils disponibles

Sous-rubriques

• Accès aux outils bio-informatiques

  Accès aux ressources de calcul et à la grille

• Découverte de motifs

  Découverte de motifs dans des séquences nucléiques ou protéiques sur des banques personnelles ou publiques.

• Recherche de motifs et modèles

  Outils de recherche de motifs et de modèles au sein d’une ou plusieurs séquences nucléiques ou protéiques

• Analyse et recherche de zones promotrices
• Recherche de similarités

  Recherche de similarités entre différentes séquences personnelles ou contre un banque publique (alignement,...)

• Alignements de séquences

  Alignements de séquences par différents algorithmes

• Contig, assemblage d’ESTs
• Clustering
• Identification de gènes
• Modulome : Découpage des séquences génomiques en modules
• Transcriptome : Etude de l’expression des gènes
• Protéome : Analyse et identification de séquences protéiques
• Structures et repliements
• Phylogénie

  Regroupement des êtres vivants en fonction de leurs liens de parenté via différents algorithmes.

• Package EMBOSS
• Génération d’amorces
• Annotation, ontologies et connaissances
• Analyse de QTL
• Comparaison de génomes
• Réseaux d’interactions

  Construction et/ou analyse de réseaux d’interaction

• Utilitaires

  Outils divers pour manipuler les séquences, transformer des données,...

• Services web

  La plateforme fournit un ensemble de services web accessibles librement.

• NGS : Next Generation Sequencing

  Outils pour le traitement des données issues des nouvelles générations de séquenceurs.