Une plateforme intégrée pour la recherche et la découverte de motifs
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La plate-forme et Biogenouest
La plate-forme au sein de Biogenouest
La principale caractéristique de cette plate-forme est l’interaction forte avec l’ensemble des autres plate-formes de Biogenouest. La plate-forme bioinformatique propose aux acteurs des autres plate-formes des ressources dans le domaine du calcul intensif et son expertise dans le domaine des bases de données.
Chaque plate-forme de Biogenouest doit par contre être en mesure d’assurer la gestion des données primaires.
On distinguera 2 grands axes dans les activités de bioinformatique de Biogenouest :- bioinformatique de recherche : recherche de nouveaux algorithmes et de nouvelles méthodes qui seront exploités par les chercheurs de Biogenouest. Cette activité correspond au domaine de recherche bioinformatique.
- bioinformatique de service : qui a une mission essentiellement technique : mise en place des moyens matériels et logiciels nécessaires à l’analyse des données
- Mission complémentaire : assistance dans l’utilisation des moyens mis en place
Les deux dernières missions "service et assistance" sont du ressort de la plate-forme bioinformatique.
Remarque : la plate-forme bioinformatique est plus un « tissu » qu’une plate-forme clairement localisée, ceci à la différences des plate-formes génotypage, protéomique, biopuce.Les acteurs de la plate-forme
La plate-forme bioinformatique dans son ensemble (service et recherche) s’appuie sur un fort potentiel humain.
Recherche : Rennes (IRISA, INSERM, Université) / Angers (LERIA) / Nantes (LINA) / Brest (ENST)
Service : Rennes (CNRS, Université, INSERM, INRA) / Nantes (INSERM) / Roscoff (CNRS) / Brest (IFREMER)
Il existe une interaction forte avec les biologistes - de plus dans la durée collaboration depuis 5 ans. Les services au sein des laboratoires ont également développé des partenariats étroits avec les biologistes. La fédération de l’ensemble service et recherche permet d’enrichir et de dynamiser le dispositif grâce au spectre très étendu des compétences affichées.
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