Horaire
Salle 1
Salle 2
Salle 3
Salle 4
9h50
1. « Les techniques de quantification absolue en protéomique » Avec l’utilisation en routine de technologies matures en protéomique, la découverte de protéines d’intérêt pour les équipes de recherche fait émerger le besoin de quantifier de manière absolue ces protéines candidates dans des échantillons biologiques variés. Plusieurs technologies se présentent comme une alternative à l’utilisation d’anticorps spécifiques.
Protéome « Protéomique haut débit » - Emmanuelle COM et Charles PINEAU
8. « Logol, outils et grammaire élaborés pour la recherche de motifs complexes dans les séquences » Les participants assisteront à une présentation de cet outil et de ses capacités, ainsi qu'à une démonstration des fonctionnalités de modélisation du langage Logol grâce à un éditeur graphique.
Plate-forme Bio-informatique - Olivier SALLOU et Catherine BELLEANNÉE
15. « Apport de la microdissection laser à l’étude des mécanismes d’acclimatation des truites lors d’un transfert d’eau douce en l’eau de mer » La truite arc-en-ciel a la capacité de réguler son homéostasie ionique lors du passage d’eau douce en eau de mer. Les ionocytes, qui représentent moins de 10% de la branchie, jouent un rôle clé dans les échanges transépithéliaux d’ions mais les mécanismes moléculaires mis en jeu restent mal connus. Nous expliquerons comment nous séparons les ionocytes par microdissection laser. Les ARN des cellules collectées sont extraits, vérifiés et amplifiés avant d’être analysés sur des puces à oligos Agilent.
Exploration fonctionnelle « Histopathologie H2P2 » - Alain FAUTREL (H2P2) et Isabelle LEGUEN (Inra Scribe)
21. « Application des nouvelles techniques génomiques à la microbiologie et à la sécurité des aliments » Cet atelier, animé par le pôle de compétitivité Valorial, présentera quelques exemples concrets d’applications.
Pôle de compétitivité Valorial
11h00
2. « Illumina Infinium HD : technologie de production exhaustive de génotype de type SNP et CNV. Exemple dans le cadre de l'Hémochromatose héréditaire » Pour rechercher les facteurs de pénétrance de l'hémochromatose, une étude de production de génotypes et de recherche d'associations génotype-phénotype est réalisée sur une cohorte de 500 patients atteints de cette maladie. Cette présentation permettra d'illustrer la technologie Illumina utilisée et de décrire les perspectives qu'elle offre dans le domaine de la génétique et de la génomique intégrative.
Génomique « Transcriptome » - Tiphaine GODEFROY (Illumina, Inc.) et Régis BOUVET (Transcriptome Rennes)
9. « Caractérisation des effets de composés d'intérêt nutritionnel sur les grandes fonctions physiologiques du petit animal » Présentation d'un projet industriel sur les effets d'un composé nutritionnel sur les fonction digestive et musculaire.
Exploration fonctionnelle « Cardiex » - Corinne CADIOU et Philippe AUBERT
16. « Analyse d’images : le point sur les nouveaux équipements et technologies » Avec l'acquisition d'une station d'analyse d'images HCS, la plate-forme bénéficie d'une avancée technologique de première importance. Que va-t-elle apporter aux utilisateurs ? Une vraie révolution à découvrir. Les microsystèmes de cultures cellulaires : le point sur les technologies actuelles et leurs applications associées à l'analyse d'images. Exemple des micopatterns 3D. (Avec la participation du laboratoire Biopuce du CEA de Grenoble.)
Exploration fonctionnelle « Imagerie-Puces à cellules » - Christiane GUILLOUZO, Rémy LE GUÉVEL, Cellomics ThermoFisher, Laboratoire Biopuce du CEA Grenoble
22. « Présentation du projet CEFBIOP, le Centre européen de formation à la bioproduction » Atlanpole Biotherapies est l’instigateur du projet de formation CEFBIOP. En quoi ce projet répond-il à des problématiques d’avenir pour le secteur biopharma ? En quoi est-il porteur pour tous les acteurs d’un pôle de compétitivité ceux-ci provenant aussi bien de la recherche académique ou clinique, de la formation que d’horizons industriels ? Et vous, quels sont vos besoins de formation ?
Pôle de compétitivité Atlanpole Biotherapies - Réjane BIHAN
11h40
3. « Plate-forme de séquençage haut débit : passé, présent, futur » L’atelier présentera la nouvelle offre de séquençage, tant au niveau des instruments, que de son fonctionnement et de son avenir. Les applications optimisées désormais accessibles au réseau des laboratoires Biogenouest et au domaine privé seront également exposées, ainsi qu’un premier bilan des projets accueillis et en attente.
Génomique « Séquençage/génotypage » - Philippe VANDENKOORNHUYSE
10. « Le regain d'intérêt des techniques BRET et HTRF dans le criblage pharmacologique » Application de ces deux méthodes d'interaction protéine - protéine pour le criblage de molécules actives dans la thérapeutique anti-cancéreuse.
Protéome « IMPACT » - Fabien GAUTIER, IMPACT
17. « Développement et caractérisation de nanovecteurs synthétiques pour la vectorisation d’acides nucléiques et de principes actifs » Développement de vecteurs synthétiques et optimisation de formulations pour le transfert de gènes et de molécules thérapeutiques : synthèse, caractérisation physico-chimique, outils d'évaluation.
Exploration fonctionnelle « Vecteurs de synthèse » SynNanoVect - Tristan MONTIER
23. « Analyse du transcriptome de jeunes germinations de Medicago truncatula sous stress hydrique » VEGEPOLYS, pôle de compétitivité du végétal présente une analyse transcriptomique à l’aide des puces Mt16KOLI1Plus, entreprise sur de jeunes plantules de la légumineuse modèle Medicago truncatula soumises à un stress hydrique modéré, ou en condition normale, pendant 72h à l’obscurité ou en photopériode réalisée par l’UMR PMS.
Pôle de compétitivité VEGEPOLYS - Anis LIMAMI (université d’Angers) et Emmanuelle ROUSSEAU (VEGEPOLYS)
13h30
4. « Présentation de l'offre en production de protéines recombinantes Intervention de collaborateurs présentant un projet commun » L'atelier permettra aux laboratoires de connaître l'offre de services mis à leur disposition ainsi que les conditions d'accès. Un exemple d'application sera présenté par un utilisateur de la plate-forme.
Protéome « Protéines recombinantes » - Laurent MARCHÉ
11. « Etude de la relation entre la structure des composants du grain de blé et la qualité nutritionnelle et fonctionnelle de la farine » L’atelier présente un exemple d'application des outils de caractérisation multi-échelle de la plate-forme Biopolymères biologie structurale (BIBS).
Analyse structurale et métabolomique « BIBS » - Hélène ROGNIAUX, Corinne RONDEAU, David ROPARTZ, Brigitte BOUCHET
18. « Programme "Génomique intégrative" de Biogenouest »
Cet atelier a pour objectif de faire le point les méthodologies d’intégration de données en Génomique et sur le programme structurant de Génomique intégrative de Biogenouest.
Nolwenn LE MEUR, Biogenouest - Daniel BARON, plate-forme Puces à ADN de Nantes
24. « Arronax: un équipement unique pour la production de radionucléides innovants destinés à la médecine nucléaire » Le cyclotron Arronax est une plate-forme de production de radionucléides innovants pour la recherche en médecine nucléaire. C'est un équipement unique par sa puissance et ses caractéristiques qui lui permettent de produire la grande majorité des radionucléides utiles en médecine.
Jean-François CHATAL, Conseiller scientifique au Cyclotron
14h10
5. « De la molécule au tissu, les potentialités de la RMN et l’IRM dans le domaine du végétal » Cet atelier permettra d’aborder des aspects du métabolisme, de la mesure de l’état hydrique au niveau cellulaire, du suivi non invasif de l’état cellulaire des tissus, de la quantification de la fraction gazeuse à l’interface des cellule et de la quantification de l’architecture des végétaux en 3D.
Exploration fonctionnelle « PRISM » - François MARIETTE, Maja MUSSE et Arnaud BONDON
12. « Génération d'anticorps monoclonaux par immunisation génique » Présentation d’un partenariat entre la plate forme Anticorps monoclonaux PADAM et la société In Cell Art. Les projets issus de ce partenariat permet aux utilisateurs d’avoir accès au savoir-faire des deux partenaires.
Protéome « Anticorps monoclonaux PADAM » - Josy FROGER et Yannic DANGER (PADAM), Bruno PITARD (In Cell Art)
19. « Méganucléases, Zinc-finger nucléases et autres nucléases... de nouveaux outils pour la Transgenèse » Présentation de ces nouveaux outils, intérêts et perspectives.
Exploration fonctionnelle
Atelier commun aux plates-formes :
« Transgenèse Rat » et « Centre de ressources Xénope » - Ignacio ANEGON, Thierry MADIGOU
25. « Création de nouvelles variétés innovantes de chou-fleur et d’artichaut : apport des biotechnologies » L’optimisation de la création variétale est l’une des préoccupations majeures de la filière légumière bretonne afin d’assurer la compétitivité des produits. L’atelier présentera les programmes développés à BBV, basés sur l’utilisation des biotechnologies, pour optimiser la sélection de nouvelles variétés performantes de chou-fleur et d’artichaut.
Céline HAMON, Bretagne Biotechnologie Végétale
14h50
6. « Vers une nouvelle plate-forme métabolomique au sein de Biogenouest » La métabolomique est une science en pleine expansion. Un groupe de réflexion et de pilotage est en cours de constitution au sein du réseau Biogenouest, qui rassemble les diverses sensibilités de nos régions. L’atelier sera l’occasion d’une réflexion interactive sur cette structuration, et fera également le point sur les besoins en métabolomique.
Atelier animé par Yves MALTHIÈRY, Biogenouest
13. « Microscopie confocale fibrée (CellVizio) pour l’étude de fonctions biologiques in vivo » La microscopie confocale fibrée, méthode d'analyse des tissus non invasive, a été utilisée pour l'étude de la fonction de reproduction des gros mammifères : la visualisation des cellules de granulosa du follicule ovarien chez la jument et la visualisation des spermatozoïdes dans le tractus génital de la brebis après insémination ont été réalisées in situ par cette méthode.
Atelier « Région Centre » - Nadine GÉRARD, INRA Nouzilly, UMR 6175
26. « La norme ISO 9001 comme outil de progrès: témoignages de plates-formes certifiées »
Des Responsables Qualité et Responsables de plates-formes Biogenouest apportent leur retour d'expériences sur la mise en place de la certification ISO 9001 au sein de leur structure, et présentent l'objectif de cette démarche et son intérêt au quotidien.
Daniel BOUJARD et Chantal PÉROT-BUSNEL (Centre de ressources Xénope), Emmanuelle COM (Protéomique haut débit), Rémi HOULGATTE (Puces à ADN)
16h00
7. « Production de vecteurs viraux et transfert de gènes in vivo » L’atelier présentera les différents vecteurs viraux produits (les technologies de production et leur caractérisation). L’intérêt de la plate‑forme réside en sa capacité à permettre la conduite de projets depuis les phases initiales in vitro jusqu’aux phases d’évaluation dans des modèles de petits ou gros animaux (modèles félins, canins et primates), qui sera illustrée par des exemples d’injection dans des modèles de maladies génétiques.
Exploration fonctionnelle « Vecteurs viraux » - Véronique BLOUIN
14. « Analyse Dynamique : apport de la vidéomicroscopie et atouts de la microscopie multiphotonique à l'étude du vivant » La plate-forme mRIC s'articule autour de 4 plateaux techniques : microscopie à épifluorescence, microscopie électronique, microscopie multiphotonique et nanosims. Le nouveau vidéomicroscope à haute résolution spatiale et temporelle sera présenté, qui permet l’observation tridimensionnelle des cellules et organismes vivants. Les atouts de la microscopie multiphotonique à l'étude du vivant seront également exposés.
Exploration fonctionnelle « microscopie Rennes imaging center (mRIC) » - Stéphanie DUTERTRE, François TIHAO
20. « Les acteurs de Biogenouest dans Capbiotek » Pour le développement économique des biotechnologies, la Bretagne a un programme : Capbiotek. L’atelier vise à analyser le rôle des plates-formes au regard du transfert de technololgie et suggérer quelques pistes d’applications industrielles potentielles.
Anne-Claude LEFEBVRE, CRITT Santé Bretagne et Gilbert BLANCHARD, CBB Développement
27. « D'HEMORGAN à HEMO2life : 2 ans de R&D pour un produit en transplantion d'organes » Le projet HEMORGAN, porté par la start-up HEMARINA et labellisé en 2007 par le Pôle Mer Bretagne, a été mené en partenariat avec deux laboratoires publics issus du CNRS et de l'Inserm. Il a permis de mettre au point la solution HEMO2life® à partir d'hémoglobine marine, qui permet d'améliorer considérablement les organes en attentes de transplantation et devrait devenir incontournable dans les prochaines années.
Proposé par le Pôle Mer Bretagne - Franck ZAL, société HEMARINA